西南大学成立于2005年7月，由原西南师范大学、原西南农业大学合并组建而成。发源于清光绪三十二年（公元1906年）在西南地区开中国新学的川东师范学堂。1950年，以川东师范学堂（后来的四川省立教育学院）、国立女子师范学院为主体，同时合并其他院校系科，分别组建了西南师范大学和西南农业大学。
西南大学历任校（院）长：陈重穆：（1984.6至1986.6任西南师范学院院长与西南师范大学校长）；钟章成：（1986.6至1993.12任西南师范大学校长）；邱玉辉：（1994.1至2005.5任西南师范大学校长）；刘鸿仁：（1984至1996.6任西南农业大学校长）；向仲怀：（1997.6至2002.12任西南农业大学校长）；王小佳：（2003.12至2005.5、2005.5至2011.5任西南大学校长）；张卫国：（2011.5到至今任西南大学校长）。
